使用前须知_基因容器 GCS_SGE集群使用指南

什么是GCS-SGE

SGE，即分布式资源管理系统（Sun Grid Engine）是传统HPC方案中常见的任务资源分配调度引擎，其主要功能如下：

• 计算节点纳管
• 任务队列管理
• 任务调度，即根据任务占用资源大小，将其分配到CPU、内存充足的计算节点上

通常情况下，SGE框架在云端使用时，纳管节点操作相对比较复杂，难以使用。特别是纳管后的节点，在任务较少时无法自动关机销毁、而任务较多时无法弹性扩容。

GCS-SGE是基因容器基于云容器实例开发的一套SGE集群管理命令行工具，GCS-SGE在SGE的基础上做了优化整改，解决了SGE架构在云端使用时节点无法自动关机销毁和弹性扩容等问题。其主要功能如下：

• 一键式增加、删除集群节点
• 根据集群任务规模，实现集群规模弹性扩缩容
• 根据单个任务规模，实现集群规格弹性扩容

GCS-SGE集群架构图如图1所示。本文中涉及的计算节点是指在CCI上创建的容器，管理节点是指在弹性云服务器中购买的ECS实例。

图1 GCS-SGE集群架构

• 当前版本暂不支持ECS类型的计算节点。
• 若计算节点需要下载数据，您还需要购买NAT网关服务，供计算节点互联网访问使用。
• 当前仅支持在北京一区和北京四区部署GCS-SGE命令行工具。

工具安装流程

GCS-SGE命令行工具安装流程，如图2所示。

图2 GCS-SGE安装流程