管理Cromwell引擎_基因容器 GCS_Cromwell引擎使用指南

创建Cromwell引擎

1. 登录GCS控制台，选择左侧导航栏的“环境管理”，在右侧页面单击“创建环境”。
2. 设置“默认环境”：是/否。若当前没有环境，则将要创建的环境即为默认环境。默认环境有且只有一个。在有多个集群时，执行测序任务时如果不指定投递环境，则将任务投递至该默认环境。
3. 选择“环境类型”为“Cromwell引擎”。
4. 选择“关联OBS存储”：OBS存储用于存储分析前后产生的数据，包括原始基因数据、流程执行中间数据及执行结果数据。
   • 如果您已有可用桶，在创建环境中，选择对应的桶即可。
   • 如果没有可用桶或是需要新建桶，请单击“创建OBS存储”创建。
   

   关联OBS存储功能目前正在公测中，如果您还未申请公测，请申请CCI容器实例挂载方式使用OBS文件桶。

5. 选择“命名空间”。

   如果您在CCI中没有可用的命名空间，或不想使用已有命名空间，请单击“创建命名空间”，创建命名空间步骤请参见命名空间。

6. 上传“访问密钥”。

   单击，在弹出的对话框中上传已下载的访问密钥（AK/SK），单击“确认”。若没有访问密钥，请前往“我的凭证” 的管理访问密钥页面新增并下载访问密钥。

7. 选择“高速共享存储”。

   “高速共享存储”对应的是文件存储服务SFS，用于存储流程中间数据。

   如果没有可用的高速共享存储，或不想使用已有高速共享存储，请单击“创建存储”，在弹出的窗口中选择已有的文件存储，单击“导入”；如果没有文件存储，请单击“创建文件存储”，具体步骤请参见创建SFS文件系统。

8. 配置RDS实例。

   Cromwell引擎需要使用一个数据库存储数据。

   您可以使用已有的RDS实例，也可以选择新建RDS实例，支持的mysql版本为5.6和5.7，新建RDS请填写如图1和图2所示参数。

   图1 创建RDS实例
   
   图2 选择RDS实例规格
   

9. 单击“下一步”，填写“环境名称”，确认环境信息配置后单击“提交”。单击“环境管理列表”将跳转“环境管理”页面，环境状态为“运行中”，环境已创建成功。
   图3 Cromwell环境