如何在Ubuntu 14.04上设置Shiny Server

原创

无敌小笼包

修改于 2018-10-25 11:18:59

3.2K0

修改于 2018-10-25 11:18:59

介绍

Shiny是一个R包，允许用户将R代码转换为交互式网页。Shiny server是RStudio提供的服务器，可用于托管和管理Web上的Shiny应用程序。除了托管Shiny应用程序，Shiny Server还可以托管交互式R降价文档。Shiny Server既有免费的开源版本，也有付费专业版，包含更多功能。

在本指南中，我们将学习如何在运行Ubuntu 14.04的腾讯CVM上设置开源Shiny Server。如果您的CVM运行的是不同版本的Ubuntu或不同的Linux发行版，则大部分说明仍然适用，但您可能需要修改某些命令以匹配您的特定发行版。您也可以使用本指南设置Shiny Server Professional。完成本指南后大约需要10-15分钟。

先决条件

在本教程中，您将需要：

Ubuntu 14.04 腾讯CVM，带2 GB RAM，没有服务器的同学可以在这里购买，不过我个人更推荐您使用免费的腾讯云开发者实验室进行试验，学会安装后再购买服务器。
安装在CVM上的最新版本的R（如何在Ubuntu 14.04上设置R）
具有sudo权限的非root用户。

本教程中的所有命令都应以非root用户身份运行。如果命令需要root访问权限，则前面会有sudo。

注：在本指南的剩余部分，当你看到你的服务器的IP，你需要用你的CVM的IP来代替它。

第1步 - 安装Shiny

在安装Shiny Server之前，我们需要安装shiny R包。我们将以一种方式安装shiny，使其可供服务器上的所有用户使用。

sudo su - -c "R -e \"install.packages('shiny', repos='http://cran.rstudio.com/')\""

注意：如果您熟悉R，则可能很想直接从R而不是从命令行安装软件包。这里使用的方法是确保为所有用户安装已安装软件包的最安全方法，而不仅仅是当前运行R的用户。

第2步 - 安装Shiny Server

我们将使用GDebi工具安装Shiny Server ，因此首先我们需要安装它。

sudo apt-get install gdebi-core

现在我们准备下载Shiny Server了。假设您的CVM正在运行64位Ubuntu，请使用以下命令下载Shiny Server。

wget -O shiny-server.deb http://download3.rstudio.org/ubuntu-12.04/x86_64/shiny-server-1.3.0.403-amd64.deb

这将下载Shiny Server版本1.3.0.403，这是撰写本文时最新的Shiny Server。如果您想下载最新版本，可以查阅官方的Shiny Server下载页面以查找最新版本并相应地更改URL。如果您运行的是32位操作系统或非Ubuntu发行版，则可能需要查阅Shiny Server下载页面，以获取有关操作系统的具体说明。

现在使用GDebi安装下载的文件。

sudo gdebi shiny-server.deb

现在应该在端口3838上安装并运行Shiny Server 。您应该能够在http://your_server_ip:3838/上

看到默认的欢迎屏幕。

您可以通过访问http://your_server_ip:3838/sample-apps/hello/确保您的Shiny Server正常工作。

第3步 - 托管交互式降价文档

Shiny Server不仅可用于托管Shiny应用程序，还可用于托管交互式R markdown文档。您可以在RStudio的官方Rmarkdown网站上了解有关交互式R降价文档的更多信息。

此时你应该有一个可以托管Shiny应用程序的工作Shiny Server，但由于没有安装rmarkdownR软件包，它还不能托管交互式R markdown文档。Shiny Server附带了一个示例交互式文档，可从以下http://your_server_ip:3838/sample-apps/rmd/位置获得。如果您现在转到该URL，您将看到错误。

让我们安装rmarkdown包来修复它。

sudo su - -c "R -e \"install.packages('rmarkdown', repos='http://cran.rstudio.com/')\""

现在，Shiny Server设置为运行交互式R markdown文档以及Shiny应用程序。要验证交互式文档是否有效，请转到http://your_server_ip:3838/sample-apps/rmd/并确保没有错误。

第4步 - 安装Shiny Server Professional（可选）

如果您购买了Shiny Server Professional许可证并希望在此服务器上使用许可证，则只执行此步骤。

购买许可证后，RStudio将为您提供用于下载Shiny Server Pro文件的URL。下载Shiny Server Pro文件。

wget -O shiny-server-pro.deb Shiny_Server_Pro_URL

安装Shiny Server Pro。

sudo gdebi shiny-server-pro.deb

您还将获得激活Shiny Server Pro所需的产品密钥。

sudo /opt/shiny-server/bin/license-manager activate Product_Key

重新启动Shiny Server Pro，以便启动激活的版本。

sudo reload shiny-server

下一步

您现在拥有一个功能强大的Shiny Server，可以托管Shiny应用程序或交互式文档。Shiny Server的配置文件位于/etc/shiny-server/shiny-server.conf。默认情况下，它配置为服务于/srv/shiny-server/目录中的应用程序。这意味着所有放置的Shiny应用程序将在公众处可用，公众可以访问/srv/shiny-server/app_name``http://your_server_ip:3838/app_name/来获取。

最好查看Shiny Server管理员指南，了解如何根据您的确切需求自定义服务器以及如何管理服务器。

要了解有关编写Shiny应用程序的更多信息，请阅读rstudio.com上的教程。

要了解有关编写交互式R降价文档的更多信息，请查看rstudio.com上的R Markdown页面。