day3-啦啦啦-linux的安装商店———miniconda
原创day3-啦啦啦-linux的安装商店———miniconda
原创
生信星球学习笔记
基于阿里云服务器召唤出Linux后，接下来我们需要给Linux上装备，本节主要介绍，如何在Linux中安装软件
Linux如何安装软件
conda 类似应用商店,需先把conda配置上，再在“应用商店”中安装软件
我们主要用的是miniconda
如何安装miniconda
先搜索资源
百度或谷歌搜索“miniconda清华”
找到Linux X64最新的miniconda，复制链接
通过Linux下载miniconda
cd biosoft -- 打开biosoft
wget 下载链接
注：wget 是Linux的下载命令
此时得到的是sh 后缀的脚本，类似安装程序，需要继续安装
卡在这里
尝试输入 source ~/.bashrc
出现 yes/no--yes
安装成功后，仍需激活source ~/.bashrc
之后选择镜像
使用北外的镜像
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
conda config --set show_channel_urls yes
miniconda 搞定
miniconda 下载fastqc
conda install fastqc -y
此处安装需要时间，绿方块前面有转圈的绿线，说明在安装，不要着急，等一会就安好了，不要手欠乱输入；要不然就是下面这样
下图提示安装成功
fastqc --help 查看是否安装成功
原创声明：本文系作者授权腾讯云开发者社区发表，未经许可，不得转载。
如有侵权，请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除。
原创声明：本文系作者授权腾讯云开发者社区发表，未经许可，不得转载。
如有侵权，请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除。