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社区首页 >专栏 >重磅!小站Easy Tools v1.1更新内容:火山图上线啦!当然这个也能提取LncRNA~更不用担心撞图,可以调配色的哦~

重磅!小站Easy Tools v1.1更新内容:火山图上线啦!当然这个也能提取LncRNA~更不用担心撞图,可以调配色的哦~

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Chris生命科学小站
发布2023-02-28 21:47:14
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发布2023-02-28 21:47:14
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能用鼠标解决的事,绝对不用代码!

只想用生信分析注释个基因,找找lncRNA,做个火山图图来展示结果,还不想学习写代码,怎么办?

Easy Tools v1.1 可以满足你的要求,下面网址是入口:

www.chrislifescience.club:3838/R/AnnoE2/

站长知道大家更喜欢点点鼠标,就得到结果!

为了帮助这绝大多数人,站长开发了这套套网站工具,

今天重点介绍如何用这个网站画漂亮的火山图:

使用教程:

需要注意的事:

一、输入的表格要求:

至少要有三列:分别是

基因名(Gene Symbol),倍数(log2FlodChange),p值(padj)

二、如果geneID是ENSG,内置注释功能,当然筛选lncRNA做火山图也只能在这种情况下使用。

三、更改完参数,刷新要等待10-20秒。这个速度站长也忍不了,以后会优化,敬请关注!

当然这个工具还可以实现

1、基因信息查询

2、基因注释ENSG to gene name,这个来源可是TCGA,Xena,还有自己的测序结果。

3、可以注释EntrezID和提取LncRNA

以上注释结果都可以下载到本地。

这个工具是夸平台的,

手机,平板,电脑都可以,

只要在浏览器输入下面这个网址:

www.chrislifescience.club:3838/R/AnnoE2

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原始发表:2019-03-27,如有侵权请联系?cloudcommunity@tencent.com 删除

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