命令总览_基因容器 GCS_CLI参考

gcs version

获取命令行工具相关版本信息。

gcs config add

输入 AK/SK/region名称并选择计算集群，初始化命令行工具。该命令将信息储存在 ~/.gcs/config.ini 文件中。

gcs config list

显示存储在 ~/.gcs/config.ini 里面的 AK/SK/region 等信息。

gcs get kubectl

获取kubernetes 命令行工具kubectl 并根据对应集群进行配置。

gcs get environment

获取租户下的环境信息，包括集群名称、状态以及内存、CPU使用情况。

gcs set env

设置默认env，设置之后，后续的任务将默认投到改环境上。

gcs get sfs

获取当前设置环境对应的集群所关联的全部sfs pvc name。

gcs set sfs

设置环境默认使用的sfs pvc。

gcs get obscli

获取obs client 命令行工具并进行相关配置。

gcs obs upload

将本地文件上传到集群绑定的对象存储桶中。

gcs get workflow

查看全部的上传模板（YAML） ID、名称、使用者、最近上传时间。也可以根据 ID指定显示特定模板的信息。

gcs create workflow

上传workflow文件。

gcs del workflow

删除workflow模板。注意：执行前需要删除引用该模板的所有任务（execution）。

gcs update workflow

更新流程的相关信息。

gcs sub workflow

在集群中，根据模板内容，创建execution。

gcs get execution

查询全部的任务信息，也可以根据ID指定显示特定任务信息。

gcs create execution

根据workflow模板创建execution任务。

gcs del execution

删除某一任务。执行后需要等待半分钟，在此期间，需要保证 kubectl get pods中， pods 全部删除。

gcs set execution

设置execution启停状态。

gcs sub job

在集群中，执行单一 shell 脚本。

gcs sub repjob

在集群中，并发执行 shell 脚本中的逐行命令，脚本中每一行命令并发创建一个job。

gcs get tool

查询租户下的所有工具信息。

gcs sub wdl

提交单个WDL流程到Cromwell引擎。

gcs get wdl

查询提交的wdl流程执行结果。

gcs set wdl

终止指定的WDL流程。

gcs get fr

获取当前用户的CCI套餐包请用情况