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小明的数据分析笔记本

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跟着Nature学数据分析:minimap2+DeepVariant流程利用hifi数据检测snp和indel
https://github.com/YaoZhou89/TGG/tree/main/4.Graph_pangenome/1.construction_graph_genome
用户7010445
2024-05-18
1130
R语言rMVP包做GWAS(全基因组关联分析)分析实例
本篇推文的示例数据来源于参考书 《Genome-Wide Association Studies》的第十章 A Practical Guide to Using Structural Variants for Genome-Wide Association Studies。
用户7010445
2024-05-18
1910
生物信息学入门- Xshell 和 Xftp 的安装 远程链接云服务器
https://www.aliyun.com/daily-act/ecs/activity_selection?source=5176.11533457&userCode=3enjgk6n
用户7010445
2024-05-18
610
生物信息学入门~在购买的云服务器上安装anaconda3用于常用的软件安装
https://www.aliyun.com/daily-act/ecs/activity_selection?source=5176.11533457&userCode=3enjgk6n
用户7010445
2024-05-18
980
R语言做基因表达量和变异位点的关联分析eQTL
http://www.bios.unc.edu/research/genomic_software/Matrix_eQTL/runit.html
用户7010445
2024-05-09
830
生物信息学入门~利用购买的云服务器学习有参转录组数据处理(fastq到差异表达)
参考基因组 拟南芥基因组 来源于 论文 The genetic and epigenetic landscape of the Arabidopsis centromeres。下载链接 https://github.com/schatzlab/Col-CEN/tree/main/v1.2
用户7010445
2024-04-30
980
使用R语言的phytools包在进化树上标记自己测序取样的样本
用户7010445
2024-04-30
690
跟着NC学作图:R语言ggplot2分组散点图和拟合曲线
https://www.nature.com/articles/s41467-024-46421-6
用户7010445
2024-04-30
1490
R语言ggplot2散点图如何使用更多的形状
如果想用其他形状,有一个R包是ggstar https://cran.r-project.org/web/packages/ggstar/vignettes/ggstar.html
用户7010445
2024-04-23
1100
有趣的数据可视化:R语言ggplot2包画云雨图展示不同地质时代恐龙的体长
https://www.kaggle.com/datasets/kjanjua/jurassic-park-the-exhaustive-dinosaur-dataset?resource=download
用户7010445
2024-04-22
810
跟着Nature Genetics学作图:R语言ggplot2画图展示基因树的拓扑结构冲突
https://doi.org/10.1038/s41588-024-01683-0
用户7010445
2024-04-15
1090
R语言ggplot2画棒棒糖图展示KEGG富集分析结果
https://www.nature.com/articles/s41588-024-01683-0
用户7010445
2024-04-15
780
R语言ggplot2折线图/散点图/作图添加水印
在小红书看到有的人直接截我公众号的图发,所以想看看能不能在图上添加水印,我搜索了一下看有没有现成的R包可以直接做这个事情。找到了一个R包 tracee
用户7010445
2024-04-15
1100
跟着Nature Plants学作图:R语言ggplot2甜甜圈图包裹饼图
https://www.nature.com/articles/s41477-024-01654-7
用户7010445
2024-04-03
1300
4种方法实现ggplot2的aes()中的变量替换
ggplot2里aes()可以用tidyselect风格去选择变量做映射绘图,那么这种情况下如何实现「变量替换」呢?
用户7010445
2024-04-03
950
跟着Nature Plants学作图:R语言ggplot2分组散点图添加置信区间/图片上插入表格
https://www.nature.com/articles/s41477-024-01654-7
用户7010445
2024-04-03
1670
Centromics 软件鉴定可能的着丝粒区域
Centromics software (https://github.com/ShuaiNIEgithub/Centromics) was used to identify centromeres
用户7010445
2024-03-22
1310
跟着Nature Communications学作图:R语言ggplot2堆积柱形图组合饼状图
https://www.nature.com/articles/s41467-024-45739-5
用户7010445
2024-03-22
1140
R语言利用cds序列计算kaks值
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.02.27.582236v1.abstract
用户7010445
2024-03-12
1690
使用StainedGlass的输出结果用R语言自己画三角形热图展示着丝粒的位置
代码链接 https://mrvollger.github.io/StainedGlass/ https://github.com/mrvollger/StainedGlass
用户7010445
2024-03-04
1251
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