暂无搜索历史
文献标题:Integrating microarray-based spatial transcriptomics and single-cell RNA-se...
首先是在Cell上发表了题为“Neutrophil profiling illuminates anti-tumor antigen-presenting po...
其实他们挖掘的是他们课题组自己的2021的文章的单细胞转录组数据:ischemic mouse brains at 5 and 14 days after tM...
但并不是所有人都是研究肿瘤的,也有一些其它领域的单细胞亚群值得整理和分享,比如软骨相关的单细胞亚群。目前主要是在腰椎间盘和骨关节相关的疾病研究看到它。而且腰椎间...
数据集是:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE220243
该论文探讨了在早期膀胱癌(BCa)中,癌相关成纤维细胞(CAFs)的异质性及其功能。通过使用scRNA和空间转录组学技术,发现了一种之前未知的表达PDGFRa+...
文章标题:《Single-cell and spatial transcriptomics of the infarcted heart define the ...
在ncount_RNA 和nFeature_RNA辅助过滤中,使用小提琴图对所有细胞中检测到的分子总数(ncount_RNA )以及基因数量(nFeature_...
上篇推文中对ncount_RNA 和nFeature_RNA进行了可视化,然后基于可视化结果进行了阈值的判断,并且也给大家分享了在实际分析中的应用
文章标题:《A Single-Cell Atlas of the Human Healthy Airways》
本研究研究通过scRNA和ST技术,详细探索了原发性结直肠癌(CRC)及其肝脏(lCRC)和卵巢(oCRC)转移的癌细胞异质性。发现一个表达蛋白酪氨酸磷酸酶受体...
百创空间转录组以原片无错高清H&E+原片无错荧光+原片测序,“三片合一”实现精准的细胞分割,将空间转录组推进到单细胞分辨率的领域。
上次给大家简单整理了一下细胞鉴定曲线图理解,里面使用nCount_RNA或者nFeature_RNA在R语言里面绘制细胞鉴定曲线,找到一个合适的cutoff值,...
文章标题:《Single-cell transcriptome atlas of the human corpus cavernosum》
绝大部分的技术原理介绍会从 单细胞悬浮液制备到测序细节面面俱到,其实并不那么的初学者友好。给大家推荐了一个高度精炼的综述,这个综述于2020年9月发表在 《Ex...
根据得到的单细胞分割结果,对数据部分特征性的cluster进行了注释,脑区中注释得到了包括:可分化为神经元和星形胶质细胞的少突胶质祖细胞,参与血脑屏障的周细胞,...
一般得到10X Genomics的下机数据之后,我们需要使用Cellranger软件进行上游数据的处理,并且生成网页报告。
文章标题:《Neuregulin 4 suppresses NASH-HCC development by restraining tumor-prone li...
背景:胰腺导管腺癌 (PDAC) 样本的bulk RNA 分析因肿瘤微环境 (TME:即来自成纤维细胞、内分泌、外分泌和免疫细胞的信号) 而变得复杂。虽然已经建...
其实文章所演示的研究者们开发的GPTCelltype做单细胞亚群注释这个过程,我们自己也是在chatGPT界面操作过,就是拿到了各个单细胞亚群的基因后的跟cha...
暂未填写公司和职称
暂未填写技能专长
暂未填写学校和专业
暂未填写个人网址
暂未填写所在城市