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反褶积严重依赖于参考矩阵S形式的单个细胞类型特征信息的可用性和准确性,其中行表示特征id(基因或DNA甲基化位点),列表示细胞类型。这个参考矩阵通常作为反卷积方...
♂ Phenotype cells by unsupervised clustering Phenotype cells using a hierarchi...
设计并实施了一项新辅助临床试验(NCT03366844)来研究pembro和局灶性放疗联合治疗TNBC患者 。50例新诊断的患者术前接受pembrots,三...
女方如果说自己不看重物质条件,男方第一感觉就是虚伪;男的说自己主要看女孩子安稳顾家,女方会觉得是在找保姆。
空间转录组学实验产生了生物组织的图谱,以及关于该图谱上位置的相关信息(一系列基因的表达)。通常,这些信息被分析为若干区域,可以是从单个细胞到大型多细胞组织的任何...
获得全单细胞分辨率的见解:最近的方法可以以真正的单细胞分辨率处理这些数据,推断出成对的单个细胞之间的通讯,如SoptSC、NICCHES、Scriabin、SP...
统计耐药、敏感病人样本中的细胞组成情况后,发现在敏感病人中免疫细胞比例更高,在耐药病人中癌症细胞比例更高。
Cancer SVG模块显示了主要富集于肾癌(8323个基因)、肝癌(6380个基因)和黑色素瘤(5964个基因)的48043个SVG的来源和特征。包括基...
在当今生命科学领域,空间组学技术(spatial omics technologies)已成为揭示生物组织结构与功能复杂交互关系的重要工具。这些技术通过在组织特...
单细胞rna测序(scRNA-seq)是一种强大的实验方法,为基因表达分析提供细胞分辨率。随着scRNA-seq技术的广泛应用,分析scRNA-seq数据的方法...
这个内容其实在stlearn中介绍过,文章在时空轨迹和空间细胞相互作用,其重要的目的是
肿瘤微环境(tumor microenvironment, TME)是一个复杂的网络,在这个网络中,肿瘤细胞不仅相互沟通,还与基质细胞和免疫细胞沟通。TME中的...
ST结合单细胞RNA测序(scRNA-seq)的优势使基因表达谱能够直接在组织内与二维空间信息相结合。与scRNA-seq分析中的聚类方法相比,ST在评估基因表...
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