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Nature Methods | 基因组学数据去卷积分析的挑战与展望

尐尐呅 1天前2024-05-11 16:50:38

去卷积是根据各种组学数据估计细胞类型丰度的有效方法。尽管近年来去卷积分析方法取得了重大进展，但挑战仍然突出。2024年2月，《Nature Methods》发表...

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Nat Methods | 谢晓亮课题组开发单细胞联合三维基因组和转录组测序技术解析嗅觉受体选择机制

生信宝典 12天前2024-04-30 17:32:03

嗅觉是我们基本的感觉之一，我们能够准确地识别各种的气味分子，这依赖于表达在嗅觉神经元表面的嗅觉受体。在哺乳动物中，嗅觉受体基因构成了最庞大的基因家族，在小鼠基因...

8110

Nat. Methods | 一个用于预测动态环境中全新蛋白-蛋白相互作用的平台

DrugAI 14天前2024-04-28 10:56:58

今天为大家介绍的是来自Ileana. M. Cristea团队的一篇论文。蛋白-蛋白相互作用（PPIs）推动细胞过程和对环境的反应，反映了细胞状态。在这里，作者...

12010

Nat. Methods | 评估GPT-4在单细胞RNA测序分析中进行细胞类型注释的应用

DrugAI 23天前2024-04-19 18:44:40

今天为大家介绍的是来自Wenpin Hou和 Zhicheng Ji团队的一篇论文。在这里，作者展示了大型语言模型GPT-4可以准确地利用单细胞RNA测序分析中...

12810

Nat Methods｜scGPT：利用生成式AI构建单细胞多组学基础模型

智药邦 2024-03-182024-03-18 11:35:57

2024年2月26日，来自加拿大多伦多大学的研究人员和微软联合在Nature Methods上发表研究scGPT: toward building a foun...

14110

Nat Methods｜AlphaFold预测是有价值的假设，可以加速但不能取代实验结构测定

智药邦 2024-03-052024-03-05 16:42:00

使用AlphaFold、RoseTTAFold和相关方法预测蛋白质结构的准确性大大优于前几代预测算法，这使人们对大分子的三维结构的理解更接近于实际。随之而来的一...

11610

空间转录组学习手册合辑

DoubleHelix 2024-03-042024-03-04 11:21:54

近年来空间转录组的各类平台层出不穷，其也被《Nature Methods》评为年度技术。这里我们整理了基于Stereopy、Squidpy、Seurat、Sca...

14210

从 Vue typings 看 “this”

三毛 2024-02-052024-02-05 14:59:27

在这个例子中，通过对 methods 的值使用 ThisType<D & M>，从而 TypeScript 推导出 methods 对象中 this 即是： {...

5110

Nat. Methods | 基于深度学习的RNA序列设计

DrugAI 2024-01-222024-01-22 11:08:39

今天为大家介绍的是来自Michiaki Hamada和Hirohide Saito团队的一篇论文。RNA工程在生物技术和医学领域有巨大潜力。尽管RNA工程非常重...

17010

Nat. Methods | 用于整合多模态数据的深度生成模型

DrugAI 2024-01-112024-01-11 14:05:36

今天为大家介绍的是来自Nir Yosef团队的一篇论文。作者提出了MultiVI，一种用于分析单细胞的转录组、染色质可访问性和其它分子特性的概率模型，这为研究细...

10910

Nat. Methods | 张阳团队开发远超AlphaFold2精度的蛋白互作结构预测算法

DrugAI 2024-01-042024-01-04 09:48:00

基因是构造生命的基本蓝图，而蛋白质则是生命功能的执行者和生命现象的体现者。细胞中的蛋白质主要是通过与细胞内其它蛋白质的相互作用来实现其绝大部分生物学功能。因此，...

48010

Cell Reports Methods | 深度几何分子学习

DrugAI 2023-12-192023-12-19 17:37:13

今天为大家介绍的是来自Jiawei Luo和Kelin Xia团队的一篇论文。分子表征学习在分子性质预测中扮演重要角色。现有的分子性质预测模型基于共价键的分子图...

23910

Nat. Methods | RoseTTAFoldNA准确预测蛋白质-核酸复合体

DrugAI 2023-12-122023-12-12 20:46:49

今天为大家介绍的是来自Frank DiMaio团队的一篇论文。蛋白质-核糖核酸（RNA）和蛋白质-脱氧核糖核酸（DNA）复合体在生物学中扮演着至关重要的角色。尽...

33110

Nat. Methods | 深度生成模型在单细胞 RNA 分析中的转录动态建模

DrugAI 2023-11-232023-11-23 14:42:39

今天为大家介绍的是来自Fabian J. Theis & Nir Yosef团队的一篇论文。当前估算 RNA 流速的方法缺乏有效的策略来量化不确定性并确定其对感...

24610

Cell Reports Methods | 功能基因组筛选和临床数据的综合分析确定了螺内酯在重症COVID-19中的保护作用

DrugAI 2023-11-222023-11-22 15:21:55

今天为大家介绍的是来Russ B. Altman, Yuan Luo 和 Le Cong 团队的一篇论文。目前出现了对现有COVID-19治疗方法具有抵抗力并且...

19510

Nat. Methods | 生物图像分析的未来：心智与机器之间的对话

DrugAI 2023-11-142023-11-14 17:03:39

今天为大家介绍的是来自Lo?c A. Royer的一篇文章。生物图像分析领域正处于一个重大转型阶段之中，这要归功于成像技术和人工智能的进步。多模态基础模型的出现...

13710

vue与flutter交互——vue

李维亮 2023-10-282023-10-28 09:52:23

定义一个方法，在方法内部使用如下语句即可。注意‘MessageDeal’方法名要与flutter端定义的方法名一致

29210

Nat. Methods | 人工智能在生物图像的应用提高科学发现速度

DrugAI 2023-10-242023-10-24 10:50:51

今天为大家介绍的是来自 Florian Jug团队的一篇文章。生物图像分析的未来越来越受深度学习和人工智能（AI）工具的发展和使用所影响。为了使这一趋势以对促进...

12920

Nat. Methods. | 复旦团队先进智能算法：蛋白质结构冷冻电镜解析分辨率大幅提升

DrugAI 2023-10-172023-10-17 14:52:19

北京时间10月9日晚，世界顶级科学期刊Nature Methods（《自然-方法》，影响因子47.99）刊发了由复旦大学马剑鹏教授领衔的科研团队开发的新型计算方...

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【iOS】The differences between Class Extension and Header File 类扩展与头文件的区别

zhaokang555 2023-10-172023-10-17 09:10:57

So this can be used to emulate restricted access for your ivars and methods. Thi...

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Nature Methods | 基因组学数据去卷积分析的挑战与展望

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Nat. Methods | 评估GPT-4在单细胞RNA测序分析中进行细胞类型注释的应用

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Nat Methods｜AlphaFold预测是有价值的假设，可以加速但不能取代实验结构测定

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Nat. Methods | RoseTTAFoldNA准确预测蛋白质-核酸复合体

Nat. Methods | 深度生成模型在单细胞 RNA 分析中的转录动态建模

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Nat. Methods | 生物图像分析的未来：心智与机器之间的对话

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