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? Monocle 3 | 太牛了！单细胞必学R包！~（七）（分析单细胞轨迹中的分支）

生信漫卷 2023-12-192023-12-19 16:15:55

然后调用graph_test()子集，识别出具有制定表达模式的基因，这些基因只落在你选择的轨迹区域内哦。?

49720

单细胞测序并不一定需要去除批次效应

生信菜鸟团 2023-12-062023-12-06 18:43:38

大家好，今天我们分享的是单细胞的学习教程https://www.singlecellworkshop.com/analysis-tutorial.html 教...

70010

? Monocle 3 | 太牛了！单细胞必学R包！~（二）（寻找marker及注释细胞）

生信漫卷 2023-11-012023-11-01 19:35:07

昨天又是不睡觉的一天，晚上还被家属讲了一通，理由是我去急诊了，没有在办公室待着，他老公疼没人去看。?

51320

离散数学与组合数学-08谓词逻辑

用户2225445 2023-10-162023-10-16 16:23:22

19820

离散数学与组合数学-06特殊的图

用户2225445 2023-10-162023-10-16 16:21:17

本文为离散数据与组合数学电子科技大学王丽杰老师的课程笔记，详细视频参考【电子科技大学】离散数学（上）王丽杰【电子科技大学】离散数学（下）王...

27930

单细胞一文打通拟时序分析monocle2

生信菜鸟团 2023-09-092023-09-09 17:09:04

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65620

单细胞——从降维聚类分群、细胞命名、到批量富集分析，一文打通GSE104154博来霉素小鼠模型单细胞数据

生信菜鸟团 2023-09-092023-09-09 16:52:58

注意：这个数据使用了ensemble id作为基因名，后续需要换为gene symbol

1.7K10

Pandas差集-交集-并集求解

皮大大 2023-08-252023-08-25 11:14:47

本文讲解的是如何利用Pandas函数求解两个DataFrame的差集、交集、并集。

25830

渠道归因（三）基于Shapley Value的渠道归因

HsuHeinrich 2023-08-102023-08-10 11:06:30

通过Shapley Value可以计算每个渠道的贡献权重，而且沙普利值的计算只需要参加的渠道总数，不考虑顺序，因此计算成本也较低。

22920

“站长，热图咋画？”——有关pheatmap包的一般用法及代码解读

Chris生命科学小站 2023-02-282023-02-28 21:34:56

热图就是很热的图，会冒火的那种图~~~数据挖掘文章必备少废话，直接上代码软件平台：R（3.4.3）library(pheatmap)library(RC...

46920

【画图】如何用画热图？

Chris生命科学小站 2023-02-282023-02-28 19:02:54

热图就是很热的图，会冒火的那种~~~ 直接上代码 library(pheatmap) library(RColorBrewer) library(ggsci...

1.4K30

这个异常检测效果

用户1908973 2023-02-142023-02-14 11:40:41

Detecting outliers is an important task in machine learning, since if left unche...

26740

如果想要删除四列中都有相同项的数据，有什么方便的方法吗？

前端皮皮 2022-12-192022-12-19 20:07:35

前几天在Python最强王者交流群【Wendy Zheng】问了一个重复值删除的问题，这里拿出来给大家分享下。

67110

数学基础从高一开始2、集合间的基本关系

红目香薰 2022-12-072022-12-07 13:52:43

列举法：选用列举法主要是因为我们能确定元素，并且可以将他们一一列出，所以可以非常直观的表示。

29110

实变函数期末复习笔记

Hsinyan 2022-08-302022-08-30 15:27:23

若A,B是非空集合，且存在双射\phi:A\rightarrow B，称A与B对等，记为A\sim B，规定\varnothing \sim \varnothi...

1.2K20

凸集与凸函数

为为为什么 2022-08-092022-08-09 19:25:06

凸函数（一元）的定义是：任意属于定义域的两个自变量x1和x2，且对于任意0≤θ≤1，如果函数f(?)满足:

56310

多维组学通路分析R包ActivePathways的使用方法及Cytoscape绘制网络图的实用教程

作图丫 2022-03-292022-03-29 09:22:39

之前我们介绍了一项整合多维组学通路分析的工作ActivePathways，能够在多个数据集中识别到显著富集的通路，包括那些在单个数据集中不明显的通路。今天来介绍...

1.8K30

美化你的单细胞各个亚群特异性高表达基因小提琴图

生信技能树 2022-03-032022-03-03 12:57:05

最近，郑州大学第一附属医院的史阳同学无私的分享了他对这些基础函数的改造，颜值说不上巅峰，但打败基础函数是没有问题的，同时也算是抛砖引玉吧，希望广大生信技能树粉...

2.1K20

美化你的单细胞亚群比例图

生信技能树 2022-03-032022-03-03 12:55:29

1K10

Python-科学计算-pandas-23-按列去重

zishendianxia 2022-02-232022-02-23 14:45:30

系统：Windows 10 编辑器：JetBrains PyCharm Community Edition 2018.2.2 x64 pandas：1.1.5

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这个异常检测效果

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